3月，英军乘胜追击，依靠人数的绝对优势分进合击，两翼包抄，迫使布尔人退出坚固的防御阵地。英军顺势占领了奥兰治首都布隆方丹。5月31日，攻克约翰内斯堡。6月5日，德兰士瓦首都比勒陀利亚失陷。德兰士瓦、奥兰治被英国吞并。
1900年9月，处于绝对劣势的布尔军队退出城市，在博塔和德韦特的领导下，分成若干小纵队，开始了旷日持久的游击战，对英军进行顽强的运动突袭。他们破坏交通线，抢截英军辎重，使英军不得安宁，遭受到更大的损失。为挫败布尔人的游击战，英军被迫将军队增至45万人，并对乡村实行“焦土”政策，大肆烧杀抢掠。同时采用集中营的办法，拘禁大批群众，企图断绝布尔军的供给。另外，还广泛建立碉堡，秘密监视布尔军动向。
◎武装起来的布尔人
在这次战争中，所有年满14岁的布尔人都要投入战斗。虽然他们没有受过专业训练，也没有精良的装备，但他们坚信自己所从事的事业是正义的。
·南非重建·
为了恢复金矿生产，英国政府与清政府于1904年签订《保工章程》，招募6万多名华工到德兰士瓦。1905年，南非的黄金生产超过之前水平。在政治上，英国重提“联邦”方案。1908年召开了开普、纳塔尔、德兰士瓦和奥兰治4个地区代表的国民会议，就“联邦”问题达成了协议。会议决定，联邦议会设在开普敦，行政首都设在比勒陀利亚，司法首都设在布隆方丹。1909年，英国国会公布了南非法案。1910年5月31日，南非联邦正式宣告成立。