汉萨商人对英国进出口贸易的控制，以及对英国商人利益的损害，激起了英国人的不满和反抗，结果汉萨商人的特权在都铎王朝前期受到了某些限制，但问题并未解决。伊丽莎白执政后，当权的威廉·塞西尔力主废除汉萨特权。1559年7月，女王专门写信给吕贝克（Lübeck）的议会，宣称汉萨特权因诸多弊端而在爱德华六世时期已被废除。不过，女王此时因地位未稳，并没有立即将汉萨商人全部赶走，而是采取了一定的妥协态度。1560年，英国与汉萨商人签订条约，允许他们重返伦敦，但他们的活动受到一定限制，而且他们在北海和尼德兰贸易中的传统优势地位也开始被打破。1579年，英国采取进一步措施，消除汉萨特权。1598年，汉萨同盟在伦敦的斯蒂尔亚德（Steelyard）的使命彻底完结，汉萨商人最后被逐出英国，从而充分保障了英商对国内市场的占领。伊丽莎白政府还通过外交谈判、签订商约等方式，确保英商在国外活动的有利条件；同时还授权英国驻外使节向驻在国政府提出英商诉求，制止外国商人和外国政府对英商的排斥、迫害。1579、1580和1581年，伊丽莎白分别致函丹麦国王、波兰国王及土耳其苏丹（Sultan），要求对方为英国公司和商人在当地的活动提供方便，并给予优惠待遇。在女王的支持下，英国商人在波罗的海、地中海等地区贸易的拓展获得了有利条件。